Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SSPNQ14714 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms