Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
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CAPSQ13938 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CAPSQ13938 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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