Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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DDX39BQ13838 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DDX39BQ13838 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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