Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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APOFQ13790 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
APOFQ13790 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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