Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TCIRG1Q13488 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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