Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 C9orf135-201ENST00000377197 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 RN7SL519P-201ENST00000497925 288 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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MKRN4PQ13434 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 AC006557.1-201ENST00000591211 1085 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MKRN4PQ13434 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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