Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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