Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDH17Q12864 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CDH17Q12864 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CDH17Q12864 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH17Q12864 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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