Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMARCB1Q12824 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMARCB1Q12824 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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