Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TROQ12816 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TROQ12816 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TROQ12816 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TROQ12816 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TROQ12816 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
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