Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SYCNQ0VAF6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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