Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC15Q0P6D6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC15Q0P6D6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms