Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4DQ08499 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4DQ08499 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms