Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPN11Q06124 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms