Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DEUP1Q05D60 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DEUP1Q05D60 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms