Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTDSPL2Q05D32 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms