Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHRNEQ04844 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms