Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CREMQ03060 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREMQ03060 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CREMQ03060 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREMQ03060 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREMQ03060 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREMQ03060 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CREMQ03060 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms