Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
E2F1Q01094 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E2F1Q01094 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms