Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDC42EP1Q00587 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDC42EP1Q00587 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms