Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVPABLB-1P60509 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVPABLB-1P60509 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms