Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHMP4BP1P59074 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHMP4BP1P59074 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms