Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL4CP56559 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARL4CP56559 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms