Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LIMK1P53667 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms