Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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