Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOSBP53539 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOSBP53539 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOSBP53539 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOSBP53539 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOSBP53539 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms