Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF143P52747 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms