Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF135P52742 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms