Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSEN2P49810 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms