Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NESP48681 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NESP48681 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NESP48681 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NESP48681 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NESP48681 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NESP48681 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NESP48681 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NESP48681 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NESP48681 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms