Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRPPRCP42704 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms