Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PIK3CBP42338 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms