Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACTR1BP42025 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ACTR1BP42025 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms