Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
CHRNA7P36544 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
CHRNA7P36544 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms