Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPN7P35236 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms