Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GPC1P35052 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GPC1P35052 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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GPC1P35052 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15□□□□□ -0.01
GPC1P35052 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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