Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC8A1P32418 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms