Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXN2P32314 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXN2P32314 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms