Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTKP29376 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTKP29376 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTKP29376 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTKP29376 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LTKP29376 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LTKP29376 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LTKP29376 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTKP29376 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTKP29376 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTKP29376 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LTKP29376 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LTKP29376 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms