Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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DUSP1P28562 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DUSP1P28562 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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