Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PSMB5P28074 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms