Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCNCP24863 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCNCP24863 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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