Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ITGB6P18564 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms