Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RHOP08100 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RHOP08100 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RHOP08100 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RHOP08100 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RHOP08100 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RHOP08100 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RHOP08100 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms