Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IFNB1P01574 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IFNB1P01574 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms