Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DCTN3O75935 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms