Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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SCN2BO60939 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SCN2BO60939 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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