Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITM2AO43736 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms