Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COCHO43405 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COCHO43405 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COCHO43405 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COCHO43405 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COCHO43405 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COCHO43405 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms