Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MTMR11A4FU01 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms